Jokowi menang pilpres. Andi kemudian terpilih menjadi Sekretaris Kabinet di periode pertama Jokowi. Ia menjabat Seskab dari 2014 hingga 2015. Andi kemudian digantikan oleh Pramono Anung.
Selepas dari Seskab, Andi tetap menjadi lingkar dekat Jokowi. Ia sering dimintai masukan secara pribadi maupun melalui KSP karena Andi menjabat Penasihat Senior KSP.
Ketika Jokowi maju untuk kali kedua di 2019, Andi tetap terlibat dalam pemenangan Jokowi. Meski tidak masuk dalam struktur Tim Kampanye Jokowi, Andi dengan kelompok relawan Cakra-19 dan Bravo-V aktif memberi masukan pada Jokowi dan tim kampanye. Ia pun kerap melakukan penggalangan relawan.
Andi sering dimintai masukan terkait pertahanan dan militer, dua isu yang memang menjadi keahliannya. Setelah Jokowi menang di 2019, ia tetap sering diminta membuat kajian soal berbagai isu. Kini, ia juga memimpin sebuah lembaga riset, LAB-45. Hingga akhirnya Jokowi menunjuk Andi sebagai Gubernur Lemhannas. [rif]
